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蛋白质突变Fitness预测Benchmark

全面评估不同模型在预测蛋白质突变效应方面的性能

概览

本项目对多种蛋白质突变预测模型在不同功能数据集上的表现进行了全面评估,包括稳定性、活性、结合和选择性。

模型总体表现(所有数据)

模型 Spearman相关性 NDCG 准确度 F1分数 论文 代码

模型总体表现(仅单点突变)

模型 Spearman相关性 NDCG 准确度 F1分数 论文 代码

稳定性

评估模型预测蛋白质突变对结构稳定性影响的能力。(仅含单点突变)

模型 Spearman相关性 NDCG 准确度 F1分数 论文 代码

活性

评估模型预测蛋白质突变对酶活性影响的能力。(仅含单点突变)

模型 Spearman相关性 NDCG 准确度 F1分数 论文 代码

蛋白质-蛋白质结合

评估模型预测蛋白质突变对蛋白质-蛋白质结合亲和力影响的能力。(仅含单点突变)

模型 Spearman相关性 NDCG 准确度 F1分数 论文 代码

蛋白质-小分子结合

评估模型预测蛋白质突变对小分子结合亲和力影响的能力。(仅含单点突变)

模型 Spearman相关性 NDCG 准确度 F1分数 论文 代码

选择性

评估模型预测蛋白质突变对选择性影响的能力。(仅含单点突变)

模型 Spearman相关性 NDCG 准确度 F1分数 论文 代码

数据下载

您可以从以下链接下载完整的数据集和结果:

研究团队

访问 Liang's lab 官方网站以及开源项目: